地中海贫血基因携带者筛查 产前检验地中海贫血基因携带者筛查新基因格医学产前检验地中海贫血——全球分布最广、累积人群最多的单基因遗传病地中海贫血（Thalassemia）又称海洋性贫血，简称地贫，是由于人体珠蛋白基因的缺失或突变使某种珠蛋白链合成减少或缺失，导致血红蛋白的组分发生改变，从而引起溶血性贫血。根据受累珠蛋白链的不同，地贫主要分为α-地中海贫血和β-地中海贫血。中国地贫主要集中在长江以南地区，四川也为高发区之一，地贫基因携带率接近5%，即：普通人群每20个人中就有一个携带者。

单细胞免疫组库测序及分析

HLA-B*5801基因检测 建议在使用别嘌醇前进行HLA-B*5801基因检测,以评估可能因基因变异而引起的毒副作用风险检测方法实时荧光定量PCR送检要求标本要求：3mL全血（EDTA抗凝），最少送检量1mL采样容器：紫色头盖管采集要求：存放条件：推荐室温保存送检；保存稳定性：室温24小时,冷藏72小时,冷冻禁止拒收标准：非EDTA抗凝；标本冷冻过。临床应用及意义1.临床使用别嘌醇时,主要的毒副作用包括史蒂文斯-约翰逊综合征和中毒性表皮坏死溶解症(SJS/TEN),严重时可导致永久性残疾甚至致命;2.HLA-B*5801等位基因在中国汉族人群中的阳性率约14-20%,阳性携带者(+)使用别嘌醇时发生SJS/TEN的毒性风险显著高于HLA-B*5801等位基因阴性(-)者;

遗传性耳聋基因检测 产前检验遗传性耳聋基因检测新基因格医学产前检验遗传性耳聋是指由于基因或染色体异常导致的耳聋，这类疾病是由父母的遗传物质发生了改变并传给后代而引起的。我国现有听力残疾人群接近3000万，居各类残疾之首。超过50%的耳聋是由遗传因素引起的。即使是听力正常的夫妇，由于携带了致聋基因，也具有生育遗传性耳聋患儿的风险。遗传性耳聋基因检测生物芯片可同时检测4个耳聋相关基因（GJB2,GJB3,SLC26A4和12SrRNA）的9个突变热点，这些位点覆盖了大多数遗传性耳聋患者和健康携带者的基因突变热点。可通过一代Sanger测序对疑似阳性进行位点验证。方法全面、可靠、准确、简捷，能有效预防先天性耳聋出生缺陷，控制药物致聋风险，预防或延缓耳聋的发生发展。

HLA-B*1502基因检测 临床使用卡马西平或奥卡西平时风险评估检测方法实时荧光定量PCR送检要求标本要求：3mL全血（EDTA抗凝），最少送检量1mL采样容器：紫色头盖管采集要求：存放条件：推荐冷藏保存送检；保存稳定性：室温24小时,冷藏72小时,冷冻禁止拒收标准：非EDTA抗凝；标本有冰冻过临床应用及意义1.临床使用卡马西平或奥卡西平时,主要的毒副作用严重的皮肤反应,包括史蒂文斯-约翰逊综合征和中毒性表皮坏死溶解症(SJS/TEN),严重时可导致永久性残疾甚至致命;2.世界卫生组织(WHO)的数据显示,一些亚洲国家出现SJS/TEN的概率较欧美人群大约要高出10倍,主要原因为亚洲患者携带阳性HLA-B*1502等位基因的可能性较大;3.癫痫患者在开始使用卡马西平或奥卡西平治疗之前,应进行HLA-B*1502等位基因检测,如经检测结果呈阳性,则不宜使用卡马西平,除非药品的预期收益明显大于严重皮肤反应风险的增加;但是没有证据显示,HLA-B*1502基因检测能够评估斑疹(MPE)与嗜酸性粒细胞增多及全身症状（DRESS）等较轻毒副作用的风险;4.有限的研究显示中国人群使用苯妥英等可能至SJS/TEN的抗癫痫药物时，HLA-B*1502等位基因可能是一个风险因子。备注本检测采用PCR法检测报告单中所列位点，其他位点不在本检测范围内项目别名苯妥英安全用药监测

多种维生素 （ADEK1）检测 多种维生素（ADEK1）检测新基因格医学孕期检验维生素是人体不可或缺的一类物质，参与机体的生长发育和物质代谢，对机体的新陈代谢、生长、发育、免疫有极重要作用。

RhD放散型血型（DEL血型） 指导DEL血型患者不必要输注长期短缺的RhD阴性稀有血液检测方法乙醚放散法送检要求标本要求：3mL全血（EDTA抗凝），最少送检量2mL采样容器：紫色头盖管采集要求：存放条件：推荐冷藏保存送检；保存稳定性：室温8小时,冷藏7天,冷冻禁止拒收标准：标本有凝块；申请单未备注患者的孕产史、是否打过抗D免疫球蛋白针及联系电话临床应用及意义RhD放散型血型（DEL血型）的准确鉴定，可以指导DEL血型患者不必要输注长期短缺的RhD阴性稀有血液，其输血原则按常规的RhD阳性对待即可，这不但可为患者节约输血费用（RhD阴性血液不仅长期短缺，而且费用为普通血液的三倍），也可以节约20-30%宝贵的RhD阴性血液，满足真阴性患者的需求；此外，对于DEL血型孕妇，其胎儿也不存在RhD新生儿溶血病的风险，其DEL血型的准确鉴定，可以减少孕期不必要的频繁血型抗体的监测，由于其不会产生抗D，也可以避免不必要的医疗干预来预防抗D产生（主要措施是注射昂贵及来源困难的抗D免疫球蛋白）。备注申请单上必须注明如下信息：1.患者的孕产史；2.是否打过抗D免疫球蛋白针；3.联系电话。项目别名DEL血型；Rh血型D放散型

药物性耳聋基因检测 新生儿检验药物性耳聋基因检测新基因格医学新生儿检验什么是药物性耳聋?顾名思义，药物性耳聋就是使用某种药物或接触某些化学制剂而引起的耳聋。根据国家颁布的《常用耳毒性药物使用规范》耳毒性药物有18类100多种，包括抗生素、利尿剂、抗疟药、抗肿瘤药、抗惊厥药、镇静剂、疫苗等，其中以氨基糖苷类抗生素造成的耳聋最多，这些药物均对人的第8对神经（听觉神经）有毒副作用。

G6PD+Hb成份分析（高分辨血红蛋白成份分析，三个月内） 适用于地中海贫血及血红蛋白病初筛检测方法送检要求标本要求：2mL全血（EDTA抗凝）采样容器：紫色头盖管采集要求：存放条件：推荐冷藏保存送检；保存稳定性：室温8小时,冷藏3天,冷冻禁止拒收标准：标本凝固；标本有凝块；重度溶血临床应用及意义辅助诊断G6PD缺乏症及辅助诊断地中海贫血和异常血红蛋白病。成人：HbA2降低，提示有可能是Alpha贫血，成人：HbA2升高，提示有可能是Beta贫血（未排除Alpha贫血）。适用于3个月内人群。备注1.静止型Aplha地中海贫血可表现为正常，Beta地中海贫血时无法排除合并Aplah地中海贫血。2.不适合输血后检测。3.Hb成份分析包括：血红蛋白A2测定(HBA2)，抗碱性血红蛋白测定(HBF)，异常血红蛋白带，红细胞孵育渗透脆性试验，RBC，MCV，MCH，MCHC，RDW，Hb和Hb包涵体检测。

Rh (D)血型,凝集反应 适用于新生儿贫血、母婴ABO血型不合、溶血现象检测方法凝集反应送检要求标本要求：2mL全血（EDTA抗凝），最少送检量0.5mL采样容器：紫色头盖管采集要求：存放条件：推荐冷藏保存送检；保存稳定性：室温8小时,冷藏7天,冷冻禁止拒收标准：重度溶血；重度脂血；标本类型不符临床应用及意义初步RH（D）定型，不适合输血/献血用途。备注初步Rh(D)定型,不适合输血/献血用途。项目别名Rh血型

染色体微阵列检测 产前检验染色体微阵列检测新基因格医学产前检验染色体微阵列检测(Optima芯片)——流产组织检测

全外显子测序 全外显子测序（Whole-exomesequencing，WES）是高频应用基因组测序方法。外显子是人基因组的蛋白编码区域，利用序列捕获技术可以将其DNA捕获并且富集。虽然外显子区域仅占全基因组1%左右[1]，却包含了85%的致病突变[2]。相比全基因组测序，全外显子测序更加经济、高效。外显子组测序主要用于识别和研究与疾病、种群进化相关的编码区及UTR区域内的变异。结合大量的公共数据库提供的外显子数据，有利于更好地解释所得变异与疾病的关系。技术优势直接对蛋白编码序列进行测序，找出影响蛋白结构的变异高深度测序，可发现变异频率低于1%的罕见变异仅针对外显子组区域，有效降低测序费用、存储空间和工作量产品应用相比于全基因组测序，外显子区域占比小（约1%），因此更容易做到更高深度测序，检测到更多低频和罕见变异，同时也能降低测序费用和存储空间。外显子测序，50M的捕获区域，测序数据量10-12Gb就可以得到100X的有效测序深度。这个特性决定了外显子测序在遗传性疾病和肿瘤研究中的重要作用，特别是做肿瘤异质性研究。由于肿瘤异质性，肿瘤内部有很多亚克隆，有些亚克隆的占比很低，应用外显子高深度测序可以更快、更经济地检测出普通测序深度难以发现的体细胞突变。图1外显子测序产品应用华大基因采用Agilent等液相捕获系统，对人的全外显子组区域的DNA进行高效捕获富集，然后提供基于DNBSEQTM测序技术的捕获测序服务。建库和杂交实验采用官方指定试剂盒，严格使用说明书推荐的试剂和耗材，并参照经过优化的实验流程进行操作。如下为DNBSEQTM外显子测序技术流程。图2DNBSEQTM平台外显子建库流程测序原理DNBSEQTM平台外显子测序产品，采用先进的联合探针锚定聚合技术（cPAS）和改进的DNA纳米球（DNB）核心测序技术，提供一站式、开放性的基因测序全面解决方案，具备精准、简易、快速、灵活、可拓展等优点，既能充分适用临床检测，也能满足更广泛的科研需求。该测序平台产品的外显子数据均一性好、单个碱基质量值高。该平台有五大关键的技术：DNB、Patternarray、cPAS、MDA-PE、sCMOS，保证了该平台测序的准确性。图3DNBSEQTM平台优势首先，单链环状DNA分子通过滚环复制，线性扩增2-3个数量级，增强信号。所产生的扩增产物称为DNA纳米球（DNAnanoball,DNB），采用高密度DNA纳米芯片技术，将得到的DNBs加到芯片上的网状小孔内（固定在阵列化的硅芯片上）。通过联合探针锚定聚合技术（cPAS）和多重置换扩增的双末端测序法（MDA-PE）得到读长为100bp/150bp的双末端序列。图4DNA纳米球示意图MDA-PE的具体原理是：完成第一链（ForwardStrand）测序后，在具备链置换功能的高保真聚合酶的作用下，合成第二链（ReverseStrand），并通过DNA分子锚，进行第二链的测序。MDA-PE法具有合成快、准确度高等优点。与其他二代测序技术相比较，DNB测序技术具有以下几个优势：DNB通过增加待测DNA的拷贝数而增强了信号强度，从而提高测序准确度。不同于PCR指数扩增，滚环扩增技术的扩增错误不会累积。DNB与芯片上的网状小孔大小相同，每个小孔只固定一个DNB，保证信号点之间不产生相互干扰。阵列化测序芯片和DNB测序技术的结合，使得成像系统像素和测序芯片的面积得到充分利用。信息分析信息分析从测序的下机数据（rawdata）开始，原始下机数据过滤掉接头、低质量碱基、未测出的碱基（以N表示）后比对到参考基因组上，进行SNP检测和InDel或者CNV分析，然后通过数据库注释，对变异检测的结果通过基于变异有害性、样本情况和基因功能表型三种分析策略，筛选出于疾病相关的有害性位点或基因。另外,为了保证高质量的测序数据，在整个分析流程中设置了严格的数据质控体系（QC）。图5疾病信息分析内容外显子测序主要适用于肿瘤易感性、致病机理、癌症异质性、转移和复发以及药物疗效研究。其中癌症异质性需要高深度测序，建议200X以上有效深度，FFPE样品建议200-300X对应的数据量，需要尽量全面、准确地检测肿瘤组织发生的所有突变信息，所以测序深度需要尽可能高，以检测低丰度突变位点。ctDNA建议500X及以上有效测序深度，用于检测Somatic突变以及频率来判断ctDNA的存在和水平，从而反应肿瘤负荷等信息。图6肿瘤信息分析内容产品优势捕获平台：Agilentv6芯片和IDT等多种探针选择测序平台：单链滚环复制，更少PCR扩增错误引入质量卓越：DNBSEQ的变异检测一致性高，对InDel检测灵敏度更高，更适合高深度的肿瘤研究项目经验：发表国内第一篇外显子测序文章，项目经验10年＋，平台稳定广泛合作：大学、医院、科研院所、制药公司合作超过6000次，样品总数16万+参考文献1.NgSB1,TurnerEH.,etal.Targetedcaptureandmassivelyparallelsequencingof12humanexomes.Nature.461(7261):272-6.2.ChoiM1,SchollUI.,etal.GeneticdiagnosisbywholeexomecaptureandmassivelyparallelDNAsequencing.ProcNatlAcadSciUSA.106(45):19096-101.

ADRB1基因多态性检测 检测方法实时荧光PCR临床应用及意义针对β受体阻滞剂（如美托洛尔、比索洛尔等）的用药指导：1.研究显示：人β1肾上腺素受体的编码基因ADRB1具有遗传多态性，常见类型为c.1165位点(G/C)的核苷酸多态性。β1受体阻断类抗高血压药的治疗效果与ADRB1基因多态性相关，可根据患者的基因型调整相应的给药剂量，以提高疗效，降低不良反应。2.根据ADRB1基因检测，结果分为以下三种：GG野生型：对β受体阻滞剂不敏感，药物疗效差，建议增加剂量或更换其他类药物；GC杂合型：对β受体阻滞剂较为敏感，建议可以常规剂量用药；CC突变型：对β受体阻断药敏感，药物疗效好，建议常规剂量或适当降低用药剂量。

LC-MS非靶向代谢组学

目标区域测序 目标区域测序（TargetRegionSequencing,TRS）是根据感兴趣的基因组区域设计特异性探针，与基因组DNA进行液相杂交，将目标基因组区域的DNA片段进行富集后再利用第二代测序技术进行测序的研究策略。图1技术流程华大可提供以下两种目标区域捕获探针：AgilentSureSelectTargetEnrichmentSystem及NimbleGenSeqCapEZChoice。1、Agilent捕获系统AgilentSureSelectTargetEnrichmentSystem液相捕获，是基于120mer的RNA寡核苷酸探针或者叫“baits”。Baits上连接的生物素，可以被链霉亲和素标记的磁珠吸附。打断后的基因组片段，与baits进行杂交，捕获目标片段。利用磁珠吸附出带有baits的DNA片段后，进行磁珠洗脱、RNA探针降解，最终获得目标区域DNA片段。图2AgilentSureSelect捕获流程2、NimbleGen捕获系统与Agilent的捕获原理类似，NimbleGen采用DNA探针，以高密度探针著称，因此价格也相对较高。如下图所示，NimbleGen利用高密度的50-105mer的DNA探针来覆盖目标区域。图3NimbleGen探针设计示意图定制化芯片型号芯片名称Reactions/kit芯片大小AgilentSureselectXTCustomKits16,961~499Kb，0.5~2.9Mb，3~5.9Mb，6Mb~11.9Mb，12Mb~24MbNimbleGenSeqCapEZChoiceKits12,24,48,96,384,960100kb-7MbNimbleGenSeqCapEZChoiceXLKits12,24,48,96,384,9607Mb-200Mb标准信息分析1.去除接头污染和低质量数据2.数据通过BWA与UCSChg19数据库进行比对3.数据产量统计分析、测序深度分析、覆盖度均一性分析4.SNP变异信息检测（SAMtools、SOAPsnp、GATK）5.SNP的RefGene注释6.SNP数据库分析（与dbSNP、千人基因组数据、ESP外显子组数据库以及炎黄基因组（仅亚太地区）数据进行数据库注释分析）7.单样品SNP保守性预测、致病性分析（仅针对人类样本，软件：SIFT、Polyphen-2、Phylop、GERPscores、Mutationassessor、Condel、FATHMM）8.SNP在各基因功能元件上的分布统计9.InDel变异信息检测(SAMtools、GATK)10.InDel的RefGene注释11.InDel数据库分析（与dbSNP、千人基因组数据、ESP外显子组数据库、炎黄基因组（仅亚太地区）进行数据库注释分析）12.InDel在各基因功能元件上的分布统计注：SIFT、Polyphen-2、Phylop、GERPscores、Mutationassessor、Condel、FATHMM这几个数据库的分析仅针对人类样本。